Habib Luthfi bin Yahya sendiri memiliki jalur yang bersambung hingga Rasulullah SAW baik dari jalur sang ayah maupun sang ibu.
Berikut nasab Habib Luthfi bin Yahya dari jalur Ibu
1. Nabi Muhammad SAW
2. Sayidatina Fatimah az-Zahra + Amirul Mukminin Ali bin Abi Thalib KWJ
3. Imam Husain ash-Sibth
4. Imam Ali Zainal 'Abidin as-Sajad
5. Imam Muhammad al-Baqir
6. Imam Ja’far ash-Shadiq
7. Imam 'Ali al-Uraidhi
8. Imam Muhammad an-Naqib