Ia kemudian melanjutkan ke Sekolah Pendidikan Guru Agama (PGA) Negeri Pamekasan, Madura.
Setelah itu, Mahfud MD kemudian melanjutkan ke Pendidikan Hakim Islam Negeri (PHIN) Yogyakarta.
Sementara pendidikan tinggi ia jalani di jurusan Hukum Tata Negara, Fakultas Hukum Universitas Islam Indonesia, Yogyakarta.
Baca Juga: Biodata dan Profil Rizal Ramli Ekonom yang Getol Kritik Pemerintah Lengkap Umur Agama dan Karir
Selain itu, ia juga mengambil Sastra Arab di Universitas Gadjah Mada Yogyakarta.
Adapun pascasarjana ia mengambil Magister Ilmu Politik di Universitas Gajah Mada Yogyakarta.
Begitu juga dengan S-3, Mahfud MD mengambil Doktor Ilmu Hukum Tata Negara juga di Universitas Gadjah Mada Yogyakarta.
Mahfud MD kemudian dianugerahi Profesor Hukum Tata Negara dari Universitas Islam Indonesia Yogyakarta.
Karir Mahfud MD tidak bisa dianggap sebelah mata, berbagai jabatan pernah ia pegang mulai dari staf ahli hingga menjadi menteri.
Mahfud MD pernah menjabat Plt. Staf Ahli dan Deputi Menteri Negara Urusan HAM pada tahun 1999 hingga tahun 2000.